Director(a):
Martí, Marcelo
Jurado:
Moffatt, Luciano - Ghiringhelli, Pablo Daniel - Abba, Martín
Institución otorgante:
Universidad de Buenos Aires.   Facultad de Farmacia y Bioquímica
Facultad de Ciencias Exactas y Naturales - Facultad de Medicina
Fecha de la defensa:
2014-07-18
Tipo de documento:
tesis de maestría - info:eu-repo/semantics/acceptedVersion
Grado alcanzado:
Magíster de la Universidad de Buenos Aires en Biología Molecular Médica 
Editor:
Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica
Formato:
application/pdf  |   kb.   |  59 p.
Idioma:
español
Area Temática:
Descripción:
Se realizó un análisis de datos de sobre-expresión diferencial genómica del organismo Mycobacterium Tuberculosis (Mt), cepa H37Rv, en ensayos in-vitro en condiciones de estrés simulando el estado de latencia del bacilo en el huésped. Este análisis se combinó con información de diferentes bases de datos bioinformáticas de dominio público a través de una nueva herramienta en desarrollo denominada Tuberquery. Esta herramienta permitió identificar una serie de Open Reading Frames (ORFs) con una determinada homología de secuencia de Protein Families (PFAM) que tienen al menos una estructura molecular detallada en el Protein Data Bank (PDB). Posteriormente se consideró información metabólica y de esencialidad para clasificar los candidatos líderes obtenidos. Finalmente, se propone la continuación de este trabajo con investigaciones de drogabilidad, off-targeting, y virtual screening necesarios para estimar la potencialidad farmacológica de los candidatos líderes obtenidos. Se plantea el beneficio de utilizar herramientas bioinformáticas para la búsqueda de nuevos objetivos moleculares como una alternativa para optimizar recursos en el comienzo del proceso racional de descubrimiento de drogas.
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Abstract:
A differential expression microarray analysis of stressed in-vitro Mycobacterium Tuberculosis (Mt), strain H37Rv, mimicking the microorganism?s latent state in the host was performed. This analysis was combined with information from various publicly available bioinformatics databases using a new tool in development called Tuberquery. This tool allowed us to identify a number of Open Reading Frames (ORFs) with a certain Protein Family (PFAM) sequence homology, for which exists at least one molecular structure listed in the Protein Data Bank (PDB). Subsequently metabolic and essentiality information was considered to classify the lead compounds obtained. Finally, we propose the follow up of this work with further research on drugability, off-targeting and virtual screening in order to estimate the pharmacological potency of the lead candidates obtained. We state the benefit of utilizing bioinformatics tools to pursue the discovery of novel drug targets as one way to optimize the resources in the beginning stages of the rational drug discovery process.
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Calificación:
Sobresaliente (10 Diez puntos)
Dictamen:
El trabajo de tesis fue expuesto en forma didáctica, concisa y clara. La redacción fue cuidadosa, ordenada y con bibliografía actualizada. Los objetivos específicos fueron concretados y abren camino a futuros proyectos. La presentación oral de la tesis fue excelente y el maestrando demostró un cabal conocimiento del tema a través de sus respuestas y de una discusión fructífera.
Identificador(es):
http://repositoriouba.sisbi.uba.ar/gsdl/cgi-bin/library.cgi?a=d&c=masteruba&cl=CL1&d=HWA_812
Filiación Institucional:
Fil: Kruk, Ivan Matías. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica; Argentina
Institución aportante:
Facultad de Farmacia y Bioquímica
Biblioteca cooperante:
Biblioteca de la Facultad de Farmacia y Bioquímica
Derechos:
info:eu-repo/semantics/openAccess
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
Licencia de uso:
Licencia Creative Commons

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Cita bibliográfica:

Kruk, Ivan Matías (2014-07-18). Búsqueda racional de blancos terapéuticos para atacar al bacilo de la tuberculosis en la fase de latencia  (tesis de maestría). Universidad de Buenos Aires.  Facultad de Farmacia y Bioquímica. [consultado:  ] Disponible en el Repositorio Digital Institucional de la Universidad de Buenos Aires:  <http://repositoriouba.sisbi.uba.ar/gsdl/cgi-bin/library.cgi?a=d&c=masteruba&cl=CL1&d=HWA_812>